Wii本体の電源を入れたら、Wiiメニュー画面で『スーパーマリオ64』の チャンネルを選びましょう。タイトル画面が表示されます。

タイトル画面でを押すとファイルセレクト画面が表示されます。でファイルを選び、またはで決定してください。 ※本ソフトフェアは1997年に発売された『スーパーマリオ64 振動パック対応バージョン』をWii上で再現したものです。画面上に「振動パック対応」と表示されておりますが、本ソフトウェアでは振動に対応しておりません。

このゲームではパワースターやカギを取るとセーブ画面が表示され、これまでの状況を保存できます。 1度取ったパワースターは半透明のカゲで表示されます。これを取るとセーブ画面に移り、進行状況が保存できます。