「リフレクト ミサイル」には赤・青・緑の3種類のステージがあります。
赤色のステージは3ターン、青色のステージは5ターン、緑色のステージは7ターン以内でのクリアをめざします。
※決められたターン数より少ないターンでクリアするとメダルが獲得できます。

また難易度で分けられた5つのクラスがありゲームを進めるとオープンしていきます。

タイトル画面から「クイックセレクション」を選ぶと、遊ぶステージが自動で選択されます。
ステージを選択する手間がなく、次々と新しいステージが遊べます。