ある朝、リンクのもとに妖精“ナビィ”がやってきた。幼なじみのサリアが喜ぶ中、ナビィは自分と一緒に“デクの樹サマ”の元へ行って欲しいとリンクに告げる。
デクの樹サマは、リンクの知恵と勇気を試した上でハイラルに眠る神の力“トライフォース”を狙う邪悪な者「ガノンドロフ」の存在と、勇者としてハイラルの大地に選ばれたリンクの運命を告げる。そして、トライフォースへと続く鍵である“森の精霊石”をリンクに託した後、デクの樹サマはガノンドロフの呪いによって静かに果てた。