「スコアアタック」モードでは、一度クリアしたステージの中から自由に選んでプレイすることができます。選んだステージだけを何度もくりかえして遊べるので、ハイスコアを目指すやりこみ要素として楽しむことができます。
ニンテンドー3DS用にステージを遊びやすく調節した「ニンテンドー3DSモード」、ニンテンドウ64当時のものを再現した本格的な「ニンテンドウ64モード」、特定の条件を満たすと選択できるさらに難しい「エクストラモード」と3種類それぞれでハイスコアに挑戦することができます。※「エクストラモード」は特定の条件を満たすことで遊ぶことができます。